Le développement de nouvelles pratiques culturales (agriculture intensive) ces dernières décennies a contribué à la pollution des sols agricoles et forestiers suivie de grande perturbation au sein de la communauté des micro-biomes (bactéries et champignons) du sol. Les micro-biomes du sol constituent une part importante de la biomasse du sol ce qui leur place parmi les acteurs essentiels qui contribuent au bon fonctionnement et de l’équilibre des écosystèmes. Leurs activités et interactions complexes dans le sol jouent un rôle crucial dans le recyclage du Carbone (C) et de l’Azote (N), définissant ainsi la structure physique et chimique du sol, de même que dans la disponibilité des éléments nutritifs indispensables à la croissance des plantes cultivées. Malgré ce rôle clé, nos connaissances sur la diversité et la composition des communautés de ces micro-biomes ainsi que l’impact des modes d’usages des sols sur ces communautés restent encore très incomplète. Une approche pour palier à ce manque de connaissances consiste à étudier la diversité phylogénétique des micro-biomes à grande échelle sur un grand nombre de sols agricoles suivant des zones climatiques et pratiques culturales indigènes ou exotique. Grâce aux récents développements des outils moléculaires, nous relierons la gestion de la fertilité des sols indigènes aux micro-biomes souterrains au moyen des techniques / méthodes moléculaires les plus modernes. Nous essayons de promouvoir les pratiques agroécologiques, en identifiant les techniques locales de gestion de la fertilité des sols qui concilient les rendements plus élevés des cultures, atténuent les émissions de gaz à effet de serre tout en préservant l’intégrité du micro-biome du sol.

Processing of forest soil samples from West Africa, Sikasso, Mali (Tchan I. Kassim, 2018)

Traitement des échantillons des sols forestiers de l’Afrique de l’Ouest, Sikasso, Mali (Tchan I. Kassim, 2018)