Systématique moléculaire et évolution des champignons tropicaux africains

Systématique moléculaire et évolution des champignons tropicaux africains

Les champignons représentent le deuxième groupe d’organismes le plus diversifié après les insectes. La variété de champignons vivants est créée par des processus évolutifs. La phylogénie moléculaire est utilisée pour reconstruire cette évolution. Les champignons tropicaux africains ne sont pas bien étudiés, tant du point de vue moléculaire que morphologique. Pourtant, de nombreux taxa présentent des caractéristiques morphologiques primitives suggérant que certaines lignées peuvent provenir d’Afrique tropicale. Suivant cet axe de recherche, nous tentons de: (1) accroître notre compréhension des limites d’espèces / genres au sein des groupes principaux, (2) évaluer le placement phylogénétique des taxa principaux, (3) élucider l’importance des taxa tropicaux africains dans les interprétations évolutives au sein des lignées. Pour assurer un hiatus clair entre les taxa, ainsi que pour détecter de nouvelles espèces possibles, nous utilisons une combinaison de taxonomie morpho-anatomique avec les techniques les plus modernes de phylogénie moléculaire basée sur plusieurs gênes. Nos taxa d’intérêt comprennent principalement les ectomycorrhiziens (Russulaceae, Inocybaceae, Boletaceae, Amanitaceae, Chantarellaceae, Thelephoraceae), les saprotrophes (le groupe des Polypores et les champignons apparentés) mais aussi les parasites (Pucciniaceae). Nous visons également à élargir l’effort d’échantillonnage géographique pour faciliter de vastes études évolutives en augmentant la disponibilité des séquences fongiques d’Afrique tropicale dans les banques internationales de gênes (GenBank, Unite, etc.).